Biyologlar - Biyolojiye Gerçekçi Yaklaşım

Agaroz Jel Elektroforezi

Jel elektroforezi, saflaştırılmış nükleik asit ve proteinlerin molekül ağırlığı, miktarı ve alt tiplerinin saptanmasında yaygın olarak kullanılan moleküler bir inceleme yöntemidir.

Agaroz Jel Elektroforezi

Jel elektroforezi, saflaştırılmış nükleik asit ve proteinlerin molekül ağırlığı, miktarı ve alt tiplerinin saptanmasında yaygın olarak kullanılan moleküler bir inceleme yöntemidir.

Besiyeri Hazırlanmasında Kullanılan Maddeler

Besiyeri bileşimine giren maddeler gelişme açısından; a) Gelişme için gerekli olanlar, b) inhibitörler olarak 2 gruba ayrılabilir. Gelişme için gerekli olan maddeler doğrudan mikroorganizmaların beslenme şekilleri ile ilgilidir ve bu maddeler besiyeri içinde bir anlamda zorunlu olarak bulunurlar. İnhibitörler ise gelişmesi istenmeyen mikroorganizmalar için gerektiğinde selektif besiyerlerine ilave edilirler. Besiyerlerine giren kimyasal maddeler hakkında aşağıda kısaca...

Apoptozis ve kaspazlar

Apoptozis, organizma tarafından düzenlenen enerji bağımlı hücre ölümüdür. Programlı hücre ölümü olarak da adlandırılan bu süreç, doku homeostazının korunmasında kritik bir role sahip olduğu gibi, fetal gelişim ve erişkin dokulardaki pekçok fizyolojik olayda da önemli rollere sahiptir. Apoptozis terimi ilk kez 1972 yılında Kerr ve arkadaşları tarafından kullanılmıştır (1). Kerr, fizyolojik olarak ölen hücrelerin çekirdeklerinde yoğunlaşmış kromatin...

İlk plazmid nasıl oluşmuştur

*Plazmidler, çoğu bakteri türünde bulunan,ancak her suşta bulunmayan halkasal veya süper sarmallı DNA molekülleridir. *Plazmitler, küçük moleküllerdir; bu açıdan bir karşılaştırma yapılırsa, bakteriyel kromozomun %20’si ile %4′ü arasında büyüklüklerde olduğu görülür. *Plazmidler, bazı üreme koşullarında konakçı hücre için mutlaka taşınması gereken yapılar değildir. Bununla birlikte, pek çok plazmid, özel koşullara uyum sağlamak için önemli...

Escherichia Coli (E.coli) Salgınları

Son günlerde Amerika’da yaşanan bir salgın ile kendini tekrar hatırlatan Escherichia Coli –E.coli- , Centers for Disease Control and Prevention (CDC)’un verilerine göre 2006’dan beri neredeyse her yıl Amerika’da salgınlara sebep olmaktadır.Bakteri insanların ve memeli hayvanların bağırsak florasında yaşar. Bu bakteriyi eğer su ya da besinlerden izole ediyorsak işte o zaman büyük bir sıkıntımız var demektir. Zira buralardan izolasyon su ya da besinlere dışkı...

Douglas Futuyma ile Evrim Kuramı’na dair söyleşi

Douglas Futuyma evrimsel biyoloji alanında çalışan bilim insanlarının ismini sıkça duyduğu, bitki böcek etkileşimleri üzerine çalışan, bilim yapmayı ve anlatmayı kendine yaşam biçimi edinmiş bir bilim insanı. ABD'deki Cornell Üniversitesi'nden lisans derecesini aldıktan sonra yüksek lisans ve doktora ünvanlarını 1969'da Michigan Üniversitesi'nden kazanıyor. Bitki yiyen böcekler ve onların konakçıları olan bitkilerin evrimi üzerine olan akademik...

DNA İZOLASYON YÖNTEMLERİ NELERDİR

DNA’nın izolasyonunda çeşitli yöntemlerden yararlanılır. Genelde izole edilen kromozal veya plazmid DNA moleküllerinin saflığının kontrolü ve miktarının tayini spektral yöntemlerle yapılmaktadır.

Hayatı Keşfeden Biyologlar

Kök hücreleri kişiye özgü bir şekilde üretmek ve bu kök hücrelerin oluşumunu moleküler düzeyde anlamayı hedefleyen Koç Üniversitesi Tıp Fakültesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim dalı Öğretim Üyesi Yrd. Doç. Dr. Tamer Önder, kök hücre ve kanser üzerine çalışmalarını, biyolog olarak nasıl bir bakış açısı yakalanması gerektiğini ve akademik hayatın tüm yönleri hakkında bilgi verdi.Biyologlar, bilimsel araştırmaların temelini oluşturacak...

Biyokimya Labaratuvarında Kullanılan Malzemeler

1. Tüpler - Deney tüpleri - Santrifuj tüpleri - Folin-wu tüpü 2. Beher ( beherglas ) 3. Erlen ( erlenmayer ) 4. Kadeh 5. Ölçü silindirleri ( mezür ) 6. Huniler 7. Kapsüller 8. Baget 9. Balon 10. Ölçü balonları ( balon joje ) 11. Piset 12. Pipet - Volümetrik pipet ( büllü pipet ) - Dereceli ( taksimatlı ) pipet - Mikropipetler - Otomatik pipetler 13. Büret 14. Bek 15. İspirto lambası 16. Havan 17. Maşa 18. Süpor ( port-tüp ) 19. Fırça 20. Spatül...

BİYOKİMYA LABORATUVARINDA KULLANILAN CAM MALZEMELER

1. Tüpler - Deney tüpleri 41. Sahli hemometresi - Santrifuj tüpleri 42. Termometre - Folin-wu tüpü 43. pH-metre 2. Beher ( beherglas ) 44. Santrifuj 3. Erlen ( erlenmayer ) 45. Spektrofotometre 4. Kadeh 46. Elektroforez 5. Ölçü silindirleri ( mezür ) 47. Otoanalizörler 6. Huniler 7. Kapsüller 8. Baget 9. Balon 10. Ölçü balonları ( balon joje ) 11. Piset 12. Pipet - Volümetrik pipet ( büllü pipet ) - Dereceli ( taksimatlı ) pipet - Mikropipetler - Otomatik...

Elektroforez

Elektroforez, bir çözeltide asılı taneciklerin, elektrik alanı etkisiyle ayrılması.Bu asılı küçük parçacıklar bakteri hücreleri,virüsler,protein molekülleri veya sentetik parçacıklar olabilir.Doğal olarak bu parçacıkların çoğu elektrik yükü taşır. Arne Tiselius tarafından geliştirilmiş olan elektroforezden, özellikle tıpta ve biyokimyada, kandaki çeşitli protein ve lipitlerin ayrılması, tanınması ve miktarının ölçülmesinde yararlanılır. Ayrıca...

ELEKTROFOREZ PROTOKOLÜ

Jel elektroforezi nedir? DNA moleküllerinin analizinde çok çeşitli yöntemler kullanılmakla birlikte tüm laboratuarlarda rutin olarak yararlanılan en basit yöntemlerden birisi jel elektroforezidir. DNA’nın elektroforetik analizinin temeli, bu molekülün elektriksel bir alanda, jel üzerinde hareketine dayanmaktadır. Bu hareketin hızı molekülün büyüklüğüne, yapısına, jelde kullanılan maddenin konsantrasyonuna, iyonik kuvvete ve uygulanan akıma bağlı olarak...

Agaroz Jel Elektroforezi

Agar ve agarozun (agaropektini olmayan agar) kullanımı nişasta jellere göre kolaydır. Agaroz daha düşük elektroozmotik etkiye sahip olduğundan daha çok tercih edilir. Agarın elektroozmotik etkisi, agaropektinin asit sülfat ve karboksilik asit gruplarından kaynaklanır. Agaroz Jel Elektroforezi Agaroz jelin avantajları proteinlere daha düşük afinitesi, mükemmel yoğunluk ölçmeye olanak sağlayan kurutma sonrası doğal saydamlığıdır. Genellikle 0.5-1.0g. agaroz/dl’lik...

DNA İzolasyonu

DNA’nın izolasyonunda çeşitli yöntemlerden yararlanılır. Genelde izole edilen kromozal veya plazmid DNA moleküllerinin saflığının kontrolü ve miktarının tayini spektral yöntemlerle yapılmaktadır. SPEKTRAL YÖNTEMLER Nükleotidlerin heterosiklik halkaları 260 nm. Dalga boyundaki ışığı max. emme özelliği taşıdığından, bu dalga boyundaki emme derecesi nükleik asitlerin miktarının bir ölçüsüdür. Buna göre DNA’nın miktar ve saflığı,spektrofotometrede...

Ekolojik Araştırmalar İçin Moleküler Tekniklerin ve Belirteçlerin Kullanılması

Ekoloji ve moleküler genetik metotlarının birleşimi evrimsel biyoloji için önemli bir gelişmedir. Moleküler ekolojistler Dünya’nın genetik çeşitliliğini araştırmak için moleküler araçları kullanırlar.

Apoptoz’un Belirlenmesinde Kullanılan Yöntemler

Apoptozisi saptamak için çok çeşitli yöntemler geliştirilmiştir. 1972 yılında, apoptozis terimi ilk kez kullanıldığında hücrenin morfolojik görünümüne göre karar verilmişti.

Apoptoz Nedir ? Hücreler neden apoptoz geçirir ? Apoptoa Aşamaları Nelerdir ?

APOPTOZ NEDİR? Apoptoz veya programlanmış hücre ölümü, vücutta doğal olarak meydana gelen bir süreçtir. Ve bu süreçlerin düzenlenmesinde önemli rol oynar. Bu tip hücre ölümü DNA’nın bir ya da daha fazla nükleozom parçalarına ayrılması, kromatin yoğunlaşması ve çekirdek parçalanması gibi özel şekilsel değişikliklerle karakterizedir. Normal şartlarda apoptoz, vücudun her bir parçasının içerik ve büyüklüğünün fizyolojik gereksinimlerin belirlediği...

Apoptoz Nedir ? Hücreler neden apoptoz geçirir ? Apoptoa Aşamaları Nelerdir ?

APOPTOZ NEDİR? Apoptoz veya programlanmış hücre ölümü, vücutta doğal olarak meydana gelen bir süreçtir. Ve bu süreçlerin düzenlenmesinde önemli rol oynar. Bu tip hücre ölümü DNA’nın bir ya da daha fazla nükleozom parçalarına ayrılması, kromatin yoğunlaşması ve çekirdek parçalanması gibi özel şekilsel değişikliklerle karakterizedir. Normal şartlarda apoptoz, vücudun her bir parçasının içerik ve büyüklüğünün fizyolojik gereksinimlerin belirlediği...

Apoptoz’un Belirlenmesinde Kullanılan Biyokimyasal Yöntemler

Blotlama Teknikleri Nelerdir ? - Blotting

Blotlama (blotting) terimi, biyolojik örneklerin bir jelden bir membrana aktarılmasını ve bunların membran yüzeyinde daha sonraki tespitini ifade eder.

Blotlama Teknikleri Nelerdir ? - Blotting

Blotlama (blotting) terimi, biyolojik örneklerin bir jelden bir membrana aktarılmasını ve bunların membran yüzeyinde daha sonraki tespitini ifade eder.

İmmünopresipitasyon (IP) Tekniği

Protein Biyolojisi Kaynak Kütüphanesi

İmmünopresipitasyon (IP) Tekniği

Protein Biyolojisi Kaynak Kütüphanesi

Kromatin Immünopresipitasyon (ChIP) Test Prosedürü

ChIP analizleri, genom ve proteom arasındaki bağlantıları, histon modifikasyonu (epigenetik olarak) veya transkripsiyon faktörleri ile DNA bağlanma etkileşimleri aracılığıyla transkripsiyon regülasyonunu takip ederek tanımlamaktadır.

Kromatin Immünopresipitasyon (ChIP) Test Prosedürü

ChIP analizleri, genom ve proteom arasındaki bağlantıları, histon modifikasyonu (epigenetik olarak) veya transkripsiyon faktörleri ile DNA bağlanma etkileşimleri aracılığıyla transkripsiyon regülasyonunu takip ederek tanımlamaktadır.