RNA İnterferansı: Ökaryotlarda Genin Susturulması
1-miRNA: Hücre içersinde, genom tarafından RNA polimeraz enziminin katalizlemiş olduğu reaksiyonla kodlanan çift iplikçikli miRNA’lar, RNA mekanizmasının temelini oluşturmaktadır.
2-siRNA: Small interfering RNA ya da short interfering RNA olarak bilinen siRNA’lar 20-25 baz çifti uzunluğunda, in vitro* sentezlenen RNA’lardır. Bu RNA’lar hücre içiersine girdiği zaman ‘Dicer’ enzimi tarafından tanınır ve yaklaşık 21-23 nükleotidlik küçük parçalara dönüştürülür ve bu parçalar RNA aracılı ile baskılama kompleksine(RISC) katılır. Oluşan komleks RISC’ın hedef mRNA’ya bağlanmasını sağlar.
3-dsRNA: çift sarmallı RNA, 21-23 nükleotid aralıklarında mRNA'nın ATP'ye bağlı bölünmesini yönlendirmektedir. DsRNA, sadece dsRNA ile özdeşlik bölgesi dahilindeki homolog RNA'ların spesifik bozulmasını tetikler.
RNA interferansı (RNAi)
RNAi dsRNA getirilmesi ile oluşturulan sekans spesifik gen susturma şeklidir. dsRNA’nın susturmaya neden olan özelliği ilk olarak C. Elegans[1] keşfedilmiştir. Keşfedilmesinden itibaren aynı özellikler ökaryotik çeşitlilikte gözlemlenmiştir.
Teknolojik yönü
RNAi gen ifadesinin deneysel kontrol için yararlı fizyolojik bir yanıttır. RNAi çalışma prensibi olarak C.elegans, Drosophila , Bitki, Trypanosoma vb. organizmalar üzerinde basit deneylerle incelendi. Bu organizmalarda bulunan dsRNA uzun yapısı gen susturulmasında değerlendirilmiştir. Organizma içersinde dsRNA üretiminin bir çok yolu vardır. In vitro sentez ile yapılabilir. dsRNA tanıtımı memeli hücrelerinde özgül olmayan zararlı etkilere sebep olur.Bu problemden kaçınmak için memeli sisteminde yapılan RNAi deneyleri küçük RNAs dsRNA taklit etmesi ile RNAi [2] nin mikro-RNA üzerinde kurduğu baskıyı gerçekleştirmiş oluyor.
Mekanizma
RNAi hedef endojen mRNA kararlı durum seviyelerinde bir düşüş olur. Hayvan hücrelerinde başlıca adım olan RNAi’nin cevabı post-transkripsiyonel ile olur. Bu mekanizmanın RNAi ve bunla bağlantılı olan post-transkripsiyonel gen susturulması (PTGS) üzerinde yoğunlaşılmıştır.
Fizyolojik yönü
Nükleik asit içersinde virüs ve transpozonlar zengin bir parazitlikleri vardır.Virüsün git geli konakçı ve çevre arasındadır ve transpozonlar konakçı her hücreninde içinde haraket halinde olabilir. Bitkilerle çalışıldığında PTGS nin oluşturduğu cevap anti-viral cevap ile benzer olduğu ortaya çıkmıştır.RNAi izlediği yol dsRNA kodlanmış geni içeren gelişimsel gen düzenleyicileri ile paylaşmaktadır bu da mikroRNA olarak adlandırılır. miRNA geni olgun miRNAs içine işlenen sabit hücre döngüsü yapılarıdır. RNA-protein kompleksi olgun miRNAs içerirler ve bu miRNA hayvan hücrelerinde mRNA üzerinde hedeflenmiş olan translasyonu engellediği ya da bitkilerde mRNA’nın tahribe uğradığı düşünülmektedir.
Hatice Kurtel
KAYNAKLAR
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC312613/
• Zamore ve diğ. 2000 ). DsRNA
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC28072/
• (1) A. Fire, et al., Nature 391, 806-811 (1998).
• (2) S. M. Elbashir, et al., Nature 411, 494-498 (2001).
• https://www.wikiwand.com/tr/Epigenetik
• *Labaratuvar ortamında ya da yapay koşullarda üretim. https://www.turkcebilgi.com/in_vitro
Genetik Haberleri
-
Bugün 16 Nisan Dünya Biyologlar Günü!
-
Allopatrik türleşme nedir ? Nasıl Gelişir ?
-
Maryland’teki “Kölelerin” Yaşayan 42.000 Akrabası Bulundu
-
Araştırmacılar kediler, yunuslar, kuşlar ve düzinelerce başka hayvanın genom haritasını çıkarıyor
-
Kolombiya'da nadir görülen bir kuş türünde "gynandromorphy" gözlemlendi
-
Kurumaya dayanıklı bitkiler için genom veritabanı yayınlandı
-
En son DNA barkodlama teknolojisiyle İsrail'in tatlı su balık türleri listesinin yeniden gözden geçirilmesi
-
İnsanların Daha Önce Bilinmeyen Bir Dokunma Duyusu Keşfedildi
-
Bilim İnsanları Tüm İnsan Genomunun Dizilimini Çıkardı. Ancak Henüz Bitmedi
-
İlk Defa Tazmanya Kaplanından RNA Elde Edildi
-
Neandertal DNA’nız, Sizi Acıya Karşı Daha Hassas Yapıyor Olabilir
-
Epigenetik ve Epigenetik Mekanizmalar
-
İlk taslaktan 20 yıl sonra insan Y kromozomu tamamen dizilendi.
-
Kim Bu Kimerizm? Tek Bedende İki Kişi
-
Gen terapi, genetik materyalin yeniden düzenlenmesi