Kurbağaları öldüren Kitrid mantarının kökeni bulundu
DNA kanıtları, dünyadaki kurbağaları yok eden ölümcül bir hastalığın kaynağı olarak Asyalı amfibilere işaret ediyor. " Fotoğraf: Güney korede yayılış gösteren turuncu karınlı kurbağa" FRANK PASMANS"
Son on yılda, dünyanın farklı bölgelerinde kurbağalar, kara kurbağaları ve semenderlerden oluşan büyük bir kitle, Batrachochytrium dendrobatidis mantarının neden olduğu ölümcül chytridiomycosis hastalığına yenik düşmüştür. Bu ani ve dramatik ölümler, ölümcül mantarların kökenini tam olarak bulmak için araştırma yapmaya yönlendirdi.
Avustralya, Kuzey ve Güney Amerika, Afrika, Asya ve Avrupa’daki vahşi ve esir amfibilerden toplanan yüzlerce B. dendrobatidis örneklerinin genomlarını analiz ettikten sonra, uluslararası bir bilim ekibi patojenlerin 20. yüzyılın başında Doğu Asya’dan ortaya çıktığını bildirdi.
Güney Florida Üniversitesi'nden ekolojist Jason Rohr, “Amfibi-chytrid dünyasında uzun zamandır ihtiyaç duyduğumuz bir çalışma türü” diyor. “Patojenin kökenleri hakkında çok fazla tartışma olması küresel bir analizinin yapılmasını gerekli kıldı.”
Araştırmaya katılmayan Maryland Üniversitesi'nden biyolog Karen Lips, “Dünyanın dört bir yanından chitrid numuneleri toplamak, onları kültürlemek ve sıralamak için yıllarca çalıştılar.” diye ekliyor. “Bu çok etkileyici bir makale.”
1998'den beri, ciltteki ozmotik dengesizliğe, organ yetmezliğine ve ölüme neden olabilen bir enfeksiyon olan chitridiomycosis, amfibi türlerinin tükenmesine neden olabilecek bir hastalık olarak tespit edilmiştir. Ancak Rohr, chytrid mantarının çevredeki değişiklikler sebebiyle (iklim değişikliği veya kirlilik gibi) sorunlu hale gelip gelmediğiyle ilgili bir tartışma olduğunu söylemiş. Mantarların özgün suşlarının, patojenle evrimsel deneyim yaşamayan popülasyonlar olduğu veya bu iki faktörün bir kombinasyonu nedeniyle oluştuğu söylenmiştir.
Bu makale bu sorunu tam olarak çözmese de Rohr, en azından dünyanın bazı bölgelerinde, bazı tecrit B. Dendrobatidislerin tamamen yeni olduklarını söylüyor.
Mantarları ortamlarından ayırıp kökenlerine ulaşmanın çok zor olmayacağı düşünülüyordu fakat epidemiyologlar, B. dendrobatidis araştırmasına önderlik eden Londra'daki Imperial College London'dan Simon O'Hanlon ve Matthew Fisher, bu işlemlerin göründüğü kadar basit bir iş olmadığını söylüyor.
Fisher, “Mantarların kültüre edilmesi oldukça zor, örneğin, Fransız Guiana yağmur ormanlarında birkaç hafta geçirerek, çalılıklara sürünen zehirli sarı kurbağa yakalayıp, ayak deri biyopsilerini aldık. Bu yolculukta 450 hayvan örnekleyip, mantardan da üç izolat aldık.”
Lips, en ironik şeyin ormanda kontrolsüzde çoğalabilen mantarın, laboratuvar ortamında hassaslaşması olduğunu söylüyor.
Ekip 177 yeni izolatın genomunu diziledi ve daha önce deşifre edilen 57 ile DNA karşılaştırmalarını yaptı. Bu analizler, BdGPL'nin dünya genelinde bulunan ve panzootik hastalıktan sorumlu baskın suşun yanı sıra yeni Asya izolatlarında bulunan iki soyun da dahil olduğu bilinen dendrobatidis soylarını tanımladı. Bunlar BdASIA-1 ve BdASIA-2.
Patojenin nükleer ve mitokondriyal DNA'sındaki mutasyon oranlarının değerlendirilmesinden sonra ekip, 120 ila 50 yıl önce Asya'dan geldiğini tahmin ediyorlar. Bu zaman dilimi, bize küresel amfibi ticaretinin genişlemesiyle çakıştığını söylüyor. B. dendrobatidis’in kökenlerini bilmek, kurbağaları koruma planları için odak noktasını bulduklarına işarettir.
Araştırmaya dahil olmayan Nevada Üniversitesi'nden chytridiomycosis araştırmacısı Jamie Voyles, muhtemelen gezegenin etrafındaki patojenlerin hareketini yavaşlatmak veya durdurmak için bir şeyler yapmamız gerekecek. ” diyor. Bu yavaşlatma ya da durdurma işlemi hayvanların hareketlerini sınırlamayı veya en azından bir tarama sürecine sahip olmayı içerebilir.
Bilinen soyların yanı sıra, araştırmacılar, farklı çeşitlerin kolaylıkla genleri değiştirebileceğini belirten, mantarın üç melez soyunu tanımladılar. Ayrıca, işlem gördüğü bilinen amfibi türlerinden alınan örneklerde tüm soyların temsilcileri bulunduğunu gördüler. “Bu çalışmanın gösterdiği şey ise, B. dendrobatidis'in aslında bir şey olmadığıdır. O tamamen bir patojen portföyü ”diyor Lips.
Çeviren ve Derleyen: Merve DARTAR
Kaynak: https://www.the-scientist.com/daily-news/origin-of-frog-killing-chytrid-fungus-found-36616
Genetik Haberleri
-
İnsanların Daha Önce Bilinmeyen Bir Dokunma Duyusu Keşfedildi
-
Bilim İnsanları Tüm İnsan Genomunun Dizilimini Çıkardı. Ancak Henüz Bitmedi
-
İlk Defa Tazmanya Kaplanından RNA Elde Edildi
-
Neandertal DNA’nız, Sizi Acıya Karşı Daha Hassas Yapıyor Olabilir
-
Epigenetik ve Epigenetik Mekanizmalar
-
İlk taslaktan 20 yıl sonra insan Y kromozomu tamamen dizilendi.
-
Kim Bu Kimerizm? Tek Bedende İki Kişi
-
Gen terapi, genetik materyalin yeniden düzenlenmesi
-
mRNA Aşıları: Genetik İnovasyonunun Yeni Yüzü ve Sağlıkta Devrimi
-
Genetik Dizilimi Yapılan En Eski Modern İnsanın Yüzünü Görün
-
Neandertal ve Denisovalı Genleri Farelere Aktarıldı
-
Yeni Dna Analizine Göre Vahşi Dingoların Çoğu Safkan
-
Eski İnsan Dişlerinde Kayıp Mikrobik Genler Bulundu
-
Antik DNA, Viking Çağının Genetik Tarihini Aydınlatıyor
-
25.000 Yıllık Kolyeden, Takan Kişinin DNA’sı Çıkarıldı!