Bilgisayar Programı İnsan Hücreleri Arasındaki Farklılıkları Algılar
“ İnsan vücudunda hücre tiplerinde ne kadar farklılık vardır? Ve bu farklılıklar nasıl gelişir? Kimse bilmiyor.” Der Profesör Stein Aerts. Credit: KU Leuven
Ama takımının geliştirdiği yeni bir metot sayesinde bu, değişebilir. Vücudumuzdaki hücrelerin her biri aynı DNA dizisi taşır. Hücre tiplerinin ve fonksiyonlarının büyük bir çeşitliliği vardır. Bu farklılıklar, DNA dizilişinin nasıl yorumlanacağını gösterir:
” Her hücrede bütün genler açık değildir.”
İnsan vücudundaki hücreler 30 trilyondan fazladır. Bu teknikler, biyolojide ve tıpta devrim araştırmaların detayının görülmemiş bir düzeyini sağlar. Biyolog Stein Aerts ve onun takımı , matematikçiler ve biyomühendislerle bu soruna katıldı. ”Biz , insanların genlerinin ifade şekillerini üzerinde hücre tiplerinin benzerlik ve farklılıklarını hızlıca ve hatasız gösteren bir bilgisayar programı geliştirdik. ( SCENIC). Bu teknoloji , hücre tiplerinin kaderinin düzeninin nasıl olduğunu daha iyi anlamamıza izin verir.
” Bu yenilikçi metot , sadece vücudumuzda farklı hücreler hakkında daha fazla bilgi öğrenmemize yardım etmez.” Der Sara Aibar Santos.
” Bu yenilikçi metot , aynı zamanda hücre aktivitelerinin zamanla nasıl değiştiğini söyler.”
Bu takım zaten insan ve farenin neyin dokularında bu metodu uygulamıştı. Aynı zamanda , vücut tümörlerini ve beyindeki kanser hücrelerini karşılaştırdılar ve analiz için kullandılar. Bu metot, İnsan Kanser Atlasını geliştirmede yardımcı olabildi.
” Bu atlas, tıp ve araştırma için bilginin paha biçilemez kaynağıdır. Bu , biyolojik değişikliklerle ilgili farklı hastalıklar ilgili sistematik çalışmalarımız için, farklı hücre tiplerinin analizi ve moleküler mekanizmasını analiz etmek için izin verir.”
Explore further: Cancer-preventing protein finds its own way in our DNA
More information: Sara Aibar et al, SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering, Nature Methods (2017). DOI: 10.1038/nmeth.4463
Journal reference: Nature Methods search and more info website
Provided by: KU Leuven
Kaynak:
https://phys.org/news/2017-10-differences-human-cells.html#jCp
Çeviren ve Derleyen: Merve Erman
Genetik Haberleri
-
Araştırmacılar kediler, yunuslar, kuşlar ve düzinelerce başka hayvanın genom haritasını çıkarıyor
-
Kolombiya'da nadir görülen bir kuş türünde "gynandromorphy" gözlemlendi
-
Kurumaya dayanıklı bitkiler için genom veritabanı yayınlandı
-
En son DNA barkodlama teknolojisiyle İsrail'in tatlı su balık türleri listesinin yeniden gözden geçirilmesi
-
İnsanların Daha Önce Bilinmeyen Bir Dokunma Duyusu Keşfedildi
-
Bilim İnsanları Tüm İnsan Genomunun Dizilimini Çıkardı. Ancak Henüz Bitmedi
-
İlk Defa Tazmanya Kaplanından RNA Elde Edildi
-
Neandertal DNA’nız, Sizi Acıya Karşı Daha Hassas Yapıyor Olabilir
-
Epigenetik ve Epigenetik Mekanizmalar
-
İlk taslaktan 20 yıl sonra insan Y kromozomu tamamen dizilendi.
-
Kim Bu Kimerizm? Tek Bedende İki Kişi
-
Gen terapi, genetik materyalin yeniden düzenlenmesi
-
mRNA Aşıları: Genetik İnovasyonunun Yeni Yüzü ve Sağlıkta Devrimi
-
Genetik Dizilimi Yapılan En Eski Modern İnsanın Yüzünü Görün
-
Neandertal ve Denisovalı Genleri Farelere Aktarıldı