Syngnathus scovelli Genomu Sekanslandı
Prof. Cresko’nun laboratuvarında yetiştirilmiş olan bu deniz iğnesi balığının kemikli zırhı daha iyice katılaşmamıştır ve çoğunluka transparan gözükmektedir. Kemikler kırmızı, kıkırdaklar da mavi renktedir. Resim Hakkı: Mark Currey.
Oregon Üniversitesi ve Teksas A&M Üniversitesi’nin oluşturduğu bir araştırma ekibi, Meksika körfezindeki deniz çayırı yataklarında sıkça bulunan bir balık türü olan deniz iğnesi balığı (Syngnathus scovelli) genomunu araştırdı ve sekansladı. Takım, sonuçlarını çevrimiçi Genome Biyoloji derisinde 20 Aralık tarihinde paylaştı.
Deniz iğnesi balığı, en az 50 milyon yıl öncesine kadar giden Syngnathidae (deniz iğnesi, deniz atı ve yapraklı deniz ejderi) ailesine aittir.
Bu ailedeki türler, vakumlamaya benzeyen beslenme şekillerine yardımcı olan uzun hortumlara sahiptir. Kemikli vücut zırhlarına sahiplerdir. Pelvik yüzgeçlere, kaburgalara ve dişlere sahip değillerdir ve erkekleri, yavruların gelişimi için olan kuluçka kendine has plasentaya benzeyen yapıları geliştirmiştir.
Oregon Üniversitesi, Ekoloji ve Evrim Enstitüsünde doktora sonrası ortak yazar Dr. Clay Small, “Bu tür grubu, genetiğin evrimsel açısından bakıldığında pek de iyi anlaşılmayan özelliklere sahiptir” dedi.
“Vücut şekilleri oldukça garip olan Syngnathidae ailesi bu türetilmiş yapı özelliklerini çalışmak için oldukça iyi bir modeldir.”
“Sonuç olarak, bu ailedeki özgün özelliklerin evrimiyle alakalı genetik değişiklikleri araştırmak istiyoruz.”
Deniz iğnesi balıklarının ve akrabalarının en önemli türetilmiş özelliklerini temsil eden bir çizim. Syngnathid balıkları, örneğin Deniz iğnesi balığı(Syngnathus scovelli),daha çok omurgaya ve uzun bir kafaya sahiptir, pelvik yüzgeçlerden ve kaburgalardan yoksunlardır ve özgün bir evrimsel özelliğe sahiplerdir; erkek kuluçka torbası. Karşılaştırma için gösterilen, tipik bir morfolojiye sahip olan ve bir percomorph olan üç dikenli balığın aksiyal iskeletidir,. Syngnathid’in kendine has tüm iskelet özellikleri burada resmedilmiştir. Resim Hakkı: C. M. Small et al, doi: 10.1186/s13059-016-1126-6
Deniz iğnesi balığı genomunun yayınlanması, Syngnathidae ailesinin bir başka ferdi olan kaplan denizatının (Hippocampus comes) genomunun Nature dergisinde yayınlanmasından sonraydı.
Oregon Üniversitesi’nden kıdemli yazar Prof. William Cresko, “Bu iki araştırmanın neredeyse eşzamanlı yayınlanması bu muhteşem balık ailesinin genom analizlerini muazzam bir şekilde ilerletti.”
Dr. Small şöyle devam etti: “Bu iki genom belirli gen ve gen işlevlerinin kaybı veya değişikliğinin evrimsel yeniliklere neden olabileceğini gösteriyor,”
“Evrim aracılığıyla, deniz iğnesi balığı ve deniz atı genomları, uzaktan balık atalarına kıyasla genetik özelliklerini kaybettiler. Bunlar, vücut dizilimi ve insan omurilik soyağacında bacaklara denk olan pelvik yüzgeçlerin noksanlığını açıklıyor.”
Takımın çabalarının büyük bir bölümü, erkek deniz iğnesi balığının kuluçka kesesinde embriyolara gebe kalabilme kabiliyetine odaklandı.
Oregon Üniversitesinden olan ortak yazar Dr. Susan Bassham “Deniz iğnesi balığı, çeşitli türlerin erkeklerinde bulunan en ayrıntılı plasental yapılardan birine örnek oluyor,” dedi.
Bir erkeğin hamilelik sırasında kesedeki gelişim sürecini, besin alışverişini ve stabiliteyi kontrol edebilmek için ortalama 1000 tane gen değişik şekillerde ifade ediliyor.
Hamile olan ve olmayan erkek deniz iğnesi balıklarını karşılaştıran bir analizde, yazarlar anormal hareket eden gen ailesi buldu.
Patristacins adı verilen bu gen ailesi, hamilelik sırasında aktive olan ve hamilelik olmadığında bastırılan bazı üyelere sahip. Bu gen grubu muhtemelen syngnathid balıklarına özeldir ve denizatlarında da benzer şekilde davranış sergilerler.
Bunun yanı sıra araştırmacılar, deniz iğnesi balığının çoğu ışıklı yüzgeçli balıklardan iki kromozom daha az taşıdığını fark etti.
Dr. Bassham,“Genomda bulunan genlerin dizilişlerine bakıldığında, bu farklılığın büyük ihtimalle dört atadan kalma kromozomun birleşip iki tane ortaya çıkarmasından kaynaklanıyor,” dedi.
“Çoğu balıkların 24 kromozomu olmasına rağmen deniz iğnesi balığının kromozom sayısı 22.”
C. M. Small et al. 2016. The genome of the Gulf pipefish enables understanding of evolutionary innovations. Genome Biology 17: 258; doi: 10.1186/s13059-016-1126-6
Çeviren ve Derleyen :Ayşegül KAZAN
Kaynak: <http://www.sci-news.com/genetics/gulf-pipefish-genome-04486.html>
Genetik Haberleri
-
Araştırmacılar kediler, yunuslar, kuşlar ve düzinelerce başka hayvanın genom haritasını çıkarıyor
-
Kolombiya'da nadir görülen bir kuş türünde "gynandromorphy" gözlemlendi
-
Kurumaya dayanıklı bitkiler için genom veritabanı yayınlandı
-
En son DNA barkodlama teknolojisiyle İsrail'in tatlı su balık türleri listesinin yeniden gözden geçirilmesi
-
İnsanların Daha Önce Bilinmeyen Bir Dokunma Duyusu Keşfedildi
-
Bilim İnsanları Tüm İnsan Genomunun Dizilimini Çıkardı. Ancak Henüz Bitmedi
-
İlk Defa Tazmanya Kaplanından RNA Elde Edildi
-
Neandertal DNA’nız, Sizi Acıya Karşı Daha Hassas Yapıyor Olabilir
-
Epigenetik ve Epigenetik Mekanizmalar
-
İlk taslaktan 20 yıl sonra insan Y kromozomu tamamen dizilendi.
-
Kim Bu Kimerizm? Tek Bedende İki Kişi
-
Gen terapi, genetik materyalin yeniden düzenlenmesi
-
mRNA Aşıları: Genetik İnovasyonunun Yeni Yüzü ve Sağlıkta Devrimi
-
Genetik Dizilimi Yapılan En Eski Modern İnsanın Yüzünü Görün
-
Neandertal ve Denisovalı Genleri Farelere Aktarıldı