Proteinlerin İşleyişini Açıklayan Yeni Bir Kuram Önerildi
ABD’de çalışan iki kimyacı, Arkansas Üniversitesi’nden Mahmoud Moradi ve North Carolina Eyalet Üniversitesi’nden lisansüstü öğrencisi Ashkan Fakharzadeh, proteinlerin ve diğer biyomoleküllerin, içerik yerine şekil ile yapı değişimine ve harekete dayanarak nasıl işlediklerini açıklayan yeni bir kuram geliştirdi. İlgili makale Journal of Physical Chemistry Letters dergisinde yayımlandı.
Proteinlere, hücrelerin ağır işçileri olan moleküller olarak bakılır. Hücresel yaşamın neredeyse tüm görevlerinden sorumludurlar; buna ürün imalatı, atık temizliği ve rutin bakımlar da dahil. Örneğin bazı proteinler, hücre ile çevresi arasında malzeme ve enformasyon taşınımından sorumludur. Bu görev, hücrenin normal işleyişi ve yaşamını sürdürmesi için yaşamsal öneme sahiptir. Protein işleyişindeki herhangi bir bozukluk hastalığa yol açabilir ve hastalıkların moleküler temellerinin anlaşılmasında, protein işlevlerinin incelenmesi gereklidir.
“İşlevlerini yerine getirmek amacıyla proteinler şekil değiştirir. Proteinler durağan nesneler olmadıkları için, uyuşumsal (İng. conformational) dinamiklerini anlamak, işlevlerinin altında yatan moleküler mekanizmaların deşifre edilmesinde atılması zorunlu bir adımdır. Dolayısıyla protein dinamiğinin incelenmesi, hastalıkların moleküler temellerini anlamada ve daha işe yarar ilaçların geliştirilmesinde “akılcı tasarımlar” kurulması açısından önemlidir,” diyor Moradi.
Protein dinamiğinde varolan kuramların, biyomoleküllerin düzenlenme uzayının eğik doğasını görmezden geldiğini belirten Moradi, yaptıkları çalışmada geometrik bir kurama dayanan yenilikçi bir formalizm geliştirdiklerini ifade ediyor. Sözünü ettiği geometrik kuramın, geleneksel olarak genel görelilikte ve benzer alanlarda kullanıldığını ekliyor ve bu sayede protein dinamiği kuramlarını modifiye ettiklerini söylüyor.
Moradi ve Fakharzadeh kuramlarını geliştirmek için biribiriyle ilişkili iki soruya odaklanacak: Proteinler yapılarını değiştirerek ve uyumlu hareketler yaparak nasıl işliyor ve bu yapısal değişimler atomik düzeyde nasıl simüle edilebilir? Bu soruları yanıtlamak, proteinlerin yapı-işlev ilişkilerine ışık tutabilir ve böylece hastalıkların moleküler düzeyde anlaşılmasına katkıda bulunabilir.
Kaynak: Phys.org, “Chemist develops new theory for explaining the function of proteins“
<https://phys.org/news/2017-01-chemist-theory-function-proteins.html>
İlgili Makale: Ashkan Fakharzadeh et al. Effective Riemannian Diffusion Model for Conformational Dynamics of Biomolecular Systems, The Journal of Physical Chemistry Letters (2016). DOI: 10.1021/acs.jpclett.6b02208
BilimFili.com"Proteinlerin İşleyişini Açıklayan Yeni Bir Kuram Önerildi" Ocak 15th, 2017
https://bilimfili.com/proteinlerin-islevini-aciklayan-yeni-bir-kuram-onerildi/
BİYOLOJİ HABERLERİ
-
Amonyum, Dünya’da Yaşamın Ortaya Çıkmasını Sağladı
-
16 Nisan, 'Dünya Biyologlar Günü'
-
Protonların Aşamalı Değişimi, ATP Sentaz Enzimi ve Mitokondriyum
-
Biyoloji Kongre Sponsorluğu
-
Dünya'da Yaşamın Nasıl Başladığının Sırrı...
-
Kazdağları Yaban Mantarları Eğitim Festivali
-
Işığın Değişmesi İle Algler
-
Trikotilomani Nedir
-
Araştırma üniversitelerinin listesi belli oldu. İşte 10 araştırma üniversitesi
-
Bilim İnsanları Tarafından Yapılan Yeni Çalışmada “Hücre İçi Saati” Bulundu
-
UCLA biyologları yaşlanmayı yavaşlatıyor, meyve sineklerinin ömrünü uzatıyor
-
Bilim insanları betalain sentezlemeyi başarmışlar. Betalain üretmenin bize faydaları nelerdir ?
-
Beyin Tanıdık Yüzleri Nasıl Ayırt Ediyor
-
Hakkâri Sat Dağlarında İki Yeni Buzul Gölü Keşfedildi
-
Her Nöron 1000’den Fazla Mutasyon Taşıyor Olabilir