E.coli, Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii, Klebsiella pneumoniae genel ve sısteamtık bilgi
E.coli
Alem: Eubacteria
Şube: Proteobacteria
Sınıf: Gamma Proteobacteria
Takım: Enterobacteriales
Familya: Enterobacteriaceae
Cins: Escherichia
Tür: E. coli
Genelde E. coli kısaltması ile veya koli basili olarak bilinen Escherichia coli (okunuşu Eşerişiya koli), memeli hayvanların kalın bağırsağında yaşayan faydalı bakteri türlerinden biridir. Normalde bağırsakta yaşadığı için, E. coli 'nin çevresel sularda varlığı dışkı kirlenmesinin bir belirtisidir.
E. coli, pediyatrist ve bakteriyolog olan Theodor Escherich tarafından bebek dışkılarında keşfedilmiştir ve adını ondan alır; coli, "kalın bağırsaktan" demektir. E. coli, genel olarak bakteri biyolojisinin anlaşılması amacıyla üzerinde sıkça çalışılmış bir model organizma olmuştur. Canlılar arasında hakkında en fazla şey bilinen organizma olduğu söylenebilir.
İnsanın bir günde dışkı yoluyla vücudundan geçen E. coli bakteri sayısı 100 milyar ila 10 trilyon arasındadır. Dışkıyı oluşturan bakteriler başlıca anerobik bakterilerdir, seçmeli anerobik E. coli hücrelerinin sayısı diğer bakteri türlerinin binde biri dolayındadır. Başka hayvanlarda etkisiz olan bazı E. coli tipleri insana bulaştıklarında hastalık yapabilirler. Bunların en ünlüsü sayılan O157:H7 adlı serotip kanlı ishale ve ölüme yol açabilir.
E. coli, normal bağırsak florasına aittir, biyolojik sınıflandırmada da bağırsaklarda yaşayan bakterilerden oluşan enterik bakteriler ailesinde yer alır. Bakteri çubuk şeklinde olup, boyutları 1-2 µm uzunluğunda ve 0.1-0.5 µm çapındadır.
E. coli Gram-negatif bir bakteri olduğundan endospor oluşturmaz, pastörizasyon veya kaynatma ile ölür. Memeli hayvanların bağırsaklarında büyümeye adapte olmuş olduğu için en iyi vücut sıcaklığında çoğalır.
Enterobacter cloacae, Enterobacter aerogenes
Kingdom: Bacteria
Phylum: Proteobacteria
Class: Gamma Proteobacteria
Order: Enterobacteriales
Family: Enterobacteriaceae
Genus: Enterobacter
Tür: Enterobacter aerogenes
Enterobacter cloacae - genel özellikleri
Gram boyanma : Negatif, basiller
Basiller : Tek tek durur.
Respirasyon tipi : Aerob
Hücreye yerleşimi : Ekstrasellüler
Kolonileri : Kanlı agarda beyaz, mukoid olabilen koloniler yapar.
Motilite : Flagella'ları ile hareket eder.
Kapsül ve glikokaliks : Küçük bir kapsülü vardır (bazende kapsül bulunmaz). Polisakkarit yapıdadır.
Class: Gamma Proteobacteria
Order: Enterobacteriales
Family: Enterobacteriaceae
Genus: Enterobacter
Tür: Enterobacter cloacae
Enterobakterilerin genel özelikleri
Enterobacteriaceae ailesi içinde, insan ve hayvan bagirsak florasinda sürekli olarak bulunurlar, bazen bagirsak florasinda yer alanlar ve bir kismi da bitkilerde bulunan heterojen bir grup bakteri bulunur.
Bu aile içinde önemli bagirsak patojenleri Shigella, Salmonalle, Yersinia’dir. Ailenin bazi üyeleride gastrointestinal sistemde normalde kolonize olurlar. Bunlar Esherichia, Enterobacter, Klebsiella gibi bakteriler olup ‘‘Enterik bakteri ’’ olarakta adlandirilirlar.
Enterobakteri ailesi içindeki bakerilerin çogu su ortak özellikleri paylasirlar.
1. Gram negatif basil olmalari
2. Sporsuz olmalari
3. Peritris kirpiklerle hareketli veya hareketsiz olmalari
4. Pepton veya etözlü besiyerlerinde, NaCi veya baska madde ilave etmeden üreme
özelliginde olmalari
5. Mac Conkey aparda iyi üremeleri
6. Fakültatif üremeleri (Aerop ve Anaerop)
7. Katalaz pozitif olmalari
8. Oksidaz negatif olmalari
9. Nitratlari nitrite çevirmeleri
10. DNA’da G+C oranlari %39 – 39 arasinda olmalari
11. Erwinia cinsi disindaki tüm enterik bakteri türlerinde ortak Enterbacteria antijen (ECA= Enterobacterial Common Antigen) bulundurmalari Enterobakteriler toprakta, suda, bitkilerde yaygin olarak bulunduklari gibi insan vehayvanlarin bagirsaklarinda yerlesirler. Insanlarin Gastrointestinal yolunun %99 dan fazlasini anaerop bakteriler olusturur çogunluguda Bacteroideslerdir. Fakat diski kültürleri aerop inkübe edildiginden rutin kültürlerde en çok enterobakteriler üremektedir. E.coli diskida bulunan en çok fakültatif bakteridir.
Enterobakteriler, Gram negatif, sporsuz basiller olup genel olarak 0.3 – 1.0μm eninde 1.0 – 6.0μm boyunda mikroorganizmalardir.
Enterobakterilerin hücre duvarlari çok tabakali bir yapi gösterirler. Hücre duvarini
olusturan Peptidoglikan, Lipoprotein, Fosfolipit, Protein ve Lipopolisakkaritler(LPS) tabakalar halindedir. Lipopolisakkartiler tasidiklari özel polisakkarit yan zincirlerle çesitli cinslerin antijenitesini belirler. Ayrica hücrenin endotoksik aktiviteden sorumlu kismidir.
Hücre duvarindan disari uzanan organeller vardir. Bu organeller diger bakterilere konak hücrelere ve bakteriyofajlara tutunmada rol oynarlar.
Enterobakteriler en iyi 35 – 37 °c de ve CO2 siz ortamda ürerler. Bazi cinsler serratia ve Yersinia düsük isilarda 1-5°c de üreyebilirler. Koloniler 18 – 24 saate görünür hale gelirler.
Enterobakterilerin üretimi için Kanli agar, Mac Conkey, EMB, Hektoenterik(HE) agar Xylose Lysine deOxcholate(XLD)agar kullanilir.
Mac Conkey veya EMB agarda laktozu formente eden türler, laktoz fermentasyon sonucu olusan asit nedeniyle pembe – kirmizi koloniler meydana getirirleri kristal viyde çöker ve nötral kirmizisi asit pH’da kirmiziya döner. Laktoz negatifler Mac Conkey agarda renksiz koloniler olusturur. Safra ve kristal viyole Gram pozitif bakterilerin üremesini engeller.
HE agarda laktoz pozitif türler sari koloniler olusturur, laktoz negatif olanlar ise yesil koloni yaparlar. H2S olusturan türler(Proteus) yesil ortasi siyah koloni olusturur.
Salmonella bakterileri(laktoz negatif) kirmizi ortasi siyah koloni olustururlar.
Enterobakterilerin çogu glikozu karmasik asit fermentasyon yolu ile fermente ederler glukoz Embden – Meyerhaf yolu ile pruvik asit gibi ara ürünler olusturarak yikilir, karmasik asitler olusur.
Enterobakterilerin cins ve türlerinin karbohidrad fermentasyonlari farklidir. Fermente edilebildikleri karbonhidradlarin ve olusan son ürünlerin farkli olusu cins ve türlerin identifikasyonunda kullanilir. Ayrica indol olusumu(Triptofan aminoasitinin yikim ürünü) ve sitrat kulanimi degerlendirilir. Triptofanaz enzimi indol, piruvik asit ve amonyak olusur. Paradimetil aminobenzaldehit(PDAB ) eklenmesi ile kirmizi renk meydana gelir. Sitrat testi, bakterilerin metabolizmasi için karbon kaynagi olarak sitrati kullanip kullanmadigi ortaya çikar. Sitratin kullanilmasi ile olusan alkali pH, brontimol indikatörünün yesilden maviye dönmesine yol açar.
Enterobakterilerin identifikasyonunda genel olarak IMVIC testi kullanilir.indol reaksiyonu(I), metil kirmizisi testi(M), Voges – Proskauer reaksiyonu(V) ve sitrat reaksiyonu(C) dur. Örnegin E.coli IMVIC testi(++--), Klebsiella IMVIC testi(--++) dir.
Enterobakterilerin antijen yapisi epidemiyoloji ve siniflandirmada önemli rol oynar.
Genel olarak;
1. Somatik(O) ag.
2. Kirpik(H) ag
3. Kapsül(K) ag.
4. ECA(Hücrenin dis yüzeyinde bulunan) agleri temel antijenlerdir.
Somatik agler bütün gram negatif bakterilerde bulunur. LPS dir. Üç bölgeden olusur.
1. bölge tekrarlayan oligosakkarit parçalarindan olusmustur. Belli cinslerde bu oligosakkaritler farklilik gösterir. 2. bölge kor polisakkaritten olusur. Bu yapi her bir cins bakteri için özeldir. 3. bölge disakkarittir(5 – 6 yag asitine tutunmustur). LPS’nin 1. bölgesindeki karbonhidradlar infeksyon sirasinda bakteri hücrelerinin konak dokuya tutunmasini saglar ve bakteriyi serumun bakterisit etkisinden korur. Somatik antijenler isiya, alkole ve asitlere dayaniklidir. Anti o antikorlari IgM niteligindedir. Formaldehite duyarlidir.
Kirpik antijenleri(H=flogella) protein yapisindadir. Hareketli türlerde bulunur. Anti H antikorlarida immunglobulinG yapisindadir. Isiya, alkole ve asite duyarlidir. Formaldehite dirençlidir. Kapsül antijenleri polisakkarit yapisindadir.
Enterobakterilerin Virulans ve Patojenite Özellikleri Adezinler çogu gram (-) bakterilerde fimbria veya pili denen yüzey organelleri vardir.
Bunlar bakterinin mukozalara tutunmasini saglar. Endotoksin hücre duvarinin LPS’inin Lipid A kismi toksik aktiviteden sorumludur. Enterotoksin genellikle ince bagirsaklari etkileyip barsak bosluguna bol sivi atimina ve diyareye neden olan toksinlerdir. E.coli,
Salmonella, Shigella, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter freundii ve Enterobacter suslari enterotoksin salgilar. Shiga toksin ve Shiga toksin benzeri toksinler bazi Shigella suslari ve E.coli suslarinca salgilanir. Hemolizinler, çesitli enterobakteri türlerince(suslarinca) salgilanan hücre disi ürünlerdir. Hemolizinlerin sitotoksik etkileri yalniz eritrositlere sinirli olmayip lenfositlerede etlindirler. Sideroforlarla demir kazanimi,Fe esansiyel bir gelisme faktörüdür.demiri siderofor denen düsük molekül agirlikli moleküller ile saglar, dolayisiyla konak organizmada canli kalabimekve barsak disi dokulara yayilabimek için kullanir.Birçok Enterobakter(Salmonella, Esherichia, Klebsiella, Shigella, Enterobacter) siderofor sentezlerler. Enterobakterilerin antibiyotik direncinden sorumlu olan direnç plazmidleride vardir. (R-Plasmidler) Kapsül enterobakterilerde antikorlarin bakteriye baglanma ve lökositlerin bakteriyi fagosite etme özelligini azaltarak bakterinin virulansina katkida bulunur. Enterobakteriler Bakteriyosin adi verilen protein yapisinda maddeler üretirler, bu maddeler duyarli bakterilerin yüzeyindeki özel reseptörlere baglanarak ölümüne yol açarlar.
Örnegin: E.colinin yaptigi bakteriyosine Colisin, Serratianin ise marcescin ve Yersinia pestis’inkine de pesticin adi verilir.
Enterobakteriler gastrointestinal yol disinda vücudun baska anatomik bölsgelerinde normalde bulunmazlar.Gastrointestinal yol disindaki infeksiyonlara en çok:E.coli,Klebsiella pneumoniae , K.oxytoca, proteu mirabilis, Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Citrobacter türlei, Serratia marcescens neden olurlar. Diyare etkeni olan baslica Enterobakteriler: çesitli E.coli serotipleri, Shigella türleri, Salmonella türleri, Yersinia enterocolitica dir. Hastane infeksiyonuna yol açan enterobacteriler:E.coli(en basta), Enterobacter türleri, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Citrobacter türleri, seratia marcescens tir.
Enterobakteriler Klinik mikrobiyoloji laboratuarlarinda kinik önemi olan izolatlarin %50 sini, izole edilen Gram negatif basillerin yaklasik %80 ini, bakteriyel gastroenteritlerin %65-70 ini, septisemilerin %50 sini, üriner sistem izolatlarinin % 70 den sorumludur.
Citrobacter freundii
Kingdom: Bacteria
Phylum: Proteobacteria
Class: Gamma Proteobacteria
Order: Enterobacteriales
Family: Enterobacteriaceae
Genus: Citrobacter
Species:C. freundii
Klebsiella pneumoniae
Kingdom: Bacteria
Phylum: Proteobacteria
Class: Gamma Proteobacteria
Order: Enterobacteriales
Family: Enterobacteriaceae
Genus: Klebsiella
Species: K. pneumoniae
BİYOLOJİ ÖDEV YARDIM
-
Mercanlar ve Mercan resifleri hakkında bilgi
-
Kulak Nedir? Kulağın Yapısı ve Görevleri Nelerdir?
-
Göz nedir ? Gözün görevleri nelerdir ? Canlılarda göz ve görme organı
-
Boğaz nedir ? Boğazın kısımları nelerdir ?
-
Omurga, columna vertebralis nedir ? Görevleri nelerdir ?
-
Doğal gübreler nelerdir
-
Kimyasal (yapay) gübreler nelerdir
-
Kortizol Nedir
-
Semantik Nedir ?
-
Karasal Ve Sucul Biyomların Özellikleri Nelerdir ?
-
Kaç çeşit biyom vardır
-
Bitki Ve Hayvanların Yeryüzündeki Dağılımını Etkileyen Faktörler Nelerdir?
-
Bitkisel dokular hakkında bilgi
-
Ekosistemde besin zinciri ve besin ağının önemi nedir ?
-
Genetik Algoritmalar